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食管炎可由不同的病因引起，如感染、化學刺激、物理性損傷、腫瘤等，造成食管下端括約肌功能障礙，經常處于松馳狀態，因此引起反復、持久、多量胃食管反流。一些原因可造成擴約肌松馳，如飲酒、吸煙、飽餐、攝入脂肪或巧克力，胃腸插管或食管賁門手術后，腹內壓增高，胃潴留等，均可導致胃食管反流。
胃酸與胃蛋白酶是反流物中損害食管粘膜的主要成份，當胃液pH<4能使胃蛋白酶具有水解活性，引起食管炎，十二指腸液也反流致食管粘膜損害，也稱為堿性反流性食管炎，反流物含有膽汁、胰液，特別是胰液中的卵磷脂，可經磷脂酶A作用而形成溶血卵磷脂，尤其是老年人胃酸分泌減少或胃酸缺乏，出現胃食管反流時，食管炎較多見。
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